Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITSN1Q15811 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
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