Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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NCOA1Q15788 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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NCOA1Q15788 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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NCOA1Q15788 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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NCOA1Q15788 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
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