Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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