Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EEA1Q15075 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEA1Q15075 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms