Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAPSQ13938 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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