Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H3Q13889 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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