Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
APOFQ13790 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
APOFQ13790 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
APOFQ13790 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
APOFQ13790 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
APOFQ13790 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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