Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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CUL4AQ13619 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL4AQ13619 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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