Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C1orf61Q13536 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C1orf61Q13536 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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