Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MKRN3Q13064 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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