Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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