Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TROQ12816 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TROQ12816 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TROQ12816 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TROQ12816 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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