Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms