Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DSC1Q08554 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms