Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FMODQ06828 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms