Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LTBQ06643 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
LTBQ06643 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
LTBQ06643 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LTBQ06643 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LTBQ06643 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LTBQ06643 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LTBQ06643 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LTBQ06643 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LTBQ06643 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LTBQ06643 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LTBQ06643 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LTBQ06643 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LTBQ06643 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LTBQ06643 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms