Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GBE1Q04446 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.3 ms