Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 DCUN1D2-AS-201ENST00000414992 330 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 C2orf74-203ENST00000432605 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AL096677.1-201ENST00000442884 814 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC114928.1-201ENST00000446516 415 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 DLGAP1-AS3-201ENST00000577649 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 NBPF22P-201ENST00000508988 1143 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 NDE1P2-201ENST00000605569 1105 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ZBTB20-AS5-203ENST00000628886 819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms