Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DEFA6Q01524 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms