Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UFM1P61960 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
UFM1P61960 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
UFM1P61960 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UFM1P61960 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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