Protein–RNA interactions for Protein: P58005

SESN3, Sestrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESN3P58005 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SESN3P58005 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SESN3P58005 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SESN3P58005 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SESN3P58005 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SESN3P58005 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms