Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms