Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2A1P52655 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2A1P52655 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GTF2A1P52655 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms