Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCA2P51531 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms