Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TAF6P49848 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms