Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NESP48681 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NESP48681 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NESP48681 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NESP48681 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NESP48681 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NESP48681 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NESP48681 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NESP48681 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NESP48681 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NESP48681 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NESP48681 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NESP48681 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NESP48681 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NESP48681 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NESP48681 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NESP48681 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NESP48681 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NESP48681 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
NESP48681 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
NESP48681 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NESP48681 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms