Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP13P45452 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MMP13P45452 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MMP13P45452 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MMP13P45452 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MMP13P45452 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MMP13P45452 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MMP13P45452 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MMP13P45452 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MMP13P45452 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MMP13P45452 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MMP13P45452 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MMP13P45452 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MMP13P45452 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MMP13P45452 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MMP13P45452 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MMP13P45452 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MMP13P45452 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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