Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GPD2P43304 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPD2P43304 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPD2P43304 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPD2P43304 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPD2P43304 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPD2P43304 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPD2P43304 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPD2P43304 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPD2P43304 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPD2P43304 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPD2P43304 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPD2P43304 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPD2P43304 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPD2P43304 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPD2P43304 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms