Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIA1P42261 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms