Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFSF9P41273 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFSF9P41273 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms