Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL4AP40617 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms