Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL1P40616 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL1P40616 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARL1P40616 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARL1P40616 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARL1P40616 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ARL1P40616 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARL1P40616 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms