Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TGFBR1P36897 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TGFBR1P36897 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms