Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPA3P35244 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPA3P35244 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms