Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCKARP32238 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCKARP32238 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCKARP32238 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCKARP32238 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCKARP32238 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCKARP32238 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCKARP32238 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCKARP32238 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms