Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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CASQ1P31415 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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CASQ1P31415 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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CASQ1P31415 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CASQ1P31415 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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