Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms