Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP1P29466 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CASP1P29466 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms