Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB5P28074 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms