Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN3P26045 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms