Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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