Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CXCL2P19875 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms