Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PGAM1P18669 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGAM1P18669 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms