Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTN1P12814 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms