Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMIM10L2BP0DMW5 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms