Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C4BP0C0L5 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms