Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
POLBP06746 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms