Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3P05106 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms