Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDST3O95803 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDST3O95803 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDST3O95803 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms