Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPBO95292 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPBO95292 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPBO95292 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms